2023年2月17日，西湖大学施一公及张晓峰共同通讯在Nature Communications 在线发表题为“Mechanisms of the RNA helicases DDX42 and DDX46 in human U2 snRNP assembly”的研究论文，该研究揭示了人U2 snRNP 组装中RNA解旋酶DDX42和DDX46的作用机制。该研究报道了DDX42-SF3b复合物的冷冻电镜结构和含有DDX42 (DDX42-U2复合物)的17S U2 snRNP的组装前体。DDX42通过N端序列锚定在SF3B1上，其N-plug占据SF3B1的RNA通路。DDX42与SF3B1的结合模式与DDX46的结合模式有着惊人的相似。
在DDX42-U2复合物中，DDX42的N端仍然锚定在SF3B1上，但解旋酶结构域已被U2 snRNA和TAT-SF1取代。通过体外实验，作者发现DDX42和DDX46在与SF3b的结合方面是互斥的。SF3B1的癌症驱动突变靶向RNA路径中直接与DDX42和DDX46相互作用的残基。这些发现揭示了DDX42和DDX46在17S U2 snRNP组装中的不同作用，并为SF3B1癌症突变的机制提供了见解。另外，2023年1月13日，西湖大学施一公、黄高兴宇及曾超共同通讯在Current Opinion in Structural Biology 在线发表题为“Structure of the nuclear pore complex goes atomic”的综述文章，该综述总结了最近在破译NPC分子细节方面的进展，这些进展在快速发展的冷冻电镜技术、X射线晶体学和机器学习支持的结构预测方面得到了极大的进展。最近在冷冻电镜(cryo-EM)重建、机器学习支持的结构预测和生化重建方面的突破结合起来，以前所未有的精度生成了NPC的分子模型。此外，在细胞冷冻电子断层扫描(cryo-ET)结构揭示了NPC的实质性结构动力学。这些进步使NPC大的组织原则和职能更加清晰。2023年1月2日，西湖大学施一公团队在Cell Research（IF=46）在线发表题为“LilrB3 is a putative cell surface receptor of APOE4”的研究论文，该研究表明LilrB3是APOE4的假定细胞表面受体。该研究证明APOE4，而不是APOE2，特异性地与白细胞免疫球蛋白样受体B3 (LilrB3)相互作用。LilrB3胞外结构域(ECD)的两个离散免疫球蛋白样结构域识别APOE4的N端结构域(NTD)上带正电荷的表面斑块。该原子结构揭示了两个APOE4分子如何特异性地与两个LilrB3分子结合，通过形成异质四聚体复合物将它们的细胞内信号基元靠近。与生化和结构分析一致，APOE4，而不是APOE2，以Lilrb3依赖的方式激活人类小胶质细胞(HMC3)进入促炎状态。总之，该研究确定LilrB3可能是APOE4的免疫细胞表面受体，而不是APOE2，这可能有助于理解APOE亚型的生物学功能和疾病相关性。最后，iNature编辑部结合Pubmed及Web of Science发现施一公团队从2014年到2023年（截至2023年3月23日）在Nature （4篇），Science （14篇），Cell （7篇），Cell Research （9篇），PNAS（15篇），Nature Communications （3篇），Protein Cell （3篇）及CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY （5篇）等发表76篇文章（包括综述及研究论文，通讯作者的有68篇文章）（文章后附列表），专注于剪接复合物，核孔复合物及分泌酶等的结构解析。另外，由于时间匆忙，如有错误，可向iNature编辑部反馈。https://www.nature.com/articles/s41467-023-36489-x
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2023-03-28
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