吴仲义蒲慕明再次呼吁及时公开共享数据！
2020-02-21
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截至2020年2月10日，共有55条2019-nCoV的病毒基因组可公开获取。其中，在1月22日以前获取的31份测序数据几乎全部来自于中国（仅有1例来自于美国）。然而1月22日以后，余下的24份数据一律源于境外，包括日本、韩国、新加坡、澳大利亚、美国、法国、英国等。
国内学术界对于所谓“高影响因子期刊”发表文章的强烈需求，远远超乎国际的惯例。扣留数据其实也反映了国内论文发表的评价体系。
研究人员对“高分期刊”过度看重的不良风气， 在这次疫情里已显示不仅仅是学术圈内的问题了。扣留数据通常不会干扰社会的正常运行，但在当前的危急情形下， 影响会是严重而深远的。
现在不要求你写大文章，也不要求你的写作符合高水平期刊的要求，请大家把数据及时共享到开放的平台上！
两周前，中山大学生命科学学院教授、台湾“中研院”院士吴仲义和中科院脑科学与智能技术卓越创新中心学术主任、中科院院士蒲慕明在《国家科学评论》撰文，呼吁同行将新冠病毒的基因组数据尽快公开。
“数据背景的断层，使我们很难在时间与地理上找到连续的规律。数据不规范公开的趋势彰显了学术界的矛盾。”
2月18日，两人再次撰文指出，在当前的危急情形下，科学家扣留数据的影响会是严重而深远的，并呼吁国内学者即时公布和共享新型冠状病毒测序数据。
为什么关心新型冠状病毒的基因测序数据？
吴仲义：目前，新型冠状病毒可能已经达到顶峰，不会再进化；但也可能蓄势待发，正要进入危险期。
在两级分化的不确定下，只有公开数据，才能让科学家知道下一步怎么走。
病毒感染人群后可能会发生快速演变，而自然选择偏好高传染力的突变。17年前SARS的爆发也体现出这样的传播规律：2002年11月至2003年1月底，SARS病毒的传播速度较为缓慢，2003年2月起开始迅速加快，这种趋势一直延续至疫情晚期。
传播加速与病毒RNA序列的改变息息相关；尤其是病毒S蛋白在传播前期快速积累了5个氨基酸突变。这说明SARS病毒从果子狸跃染到人之后，经历了一系列的遗传适应性改变。
目前我们已经看到，两场流行病的特征有诸多不同，但这大多是临床分析上的。如果能尽快获得病毒基因组数据，就可以通过对比两种病毒进化动态的差异，更准确地判断疫情，也更精准地进行防控。
蒲慕明：作为作为科研人员，在很急切地寻找基础数据、想研究这个病毒到底有没有变异时，我们却发现，很难找到较新的国内研究数据，
这很不正常。因为国内有更多的病毒材料，也掌握了更多的相关数据，能开展测序工作的科研人员也并不少。
国内哪些机构能获得新型冠状病毒基因组的最新序列数据？
蒲慕明：很多地方能做，要求就是第一能拿到病毒，第二具备有资质的病毒实验室。理论上1月22日以前发表序列的这些机构都能做。
如此重要的测序数据，在公共平台上却难以查找，这是什么原因导致的？
吴仲义：数据是有的，为何不发我们不知道。
蒲慕明：我们国内没有一个公开的地方可以去查这些数据，这的确很奇怪。我们只能推测有可能是科研人员希望用这些数据去写论文，发表在高影响因子的期刊上。
如果真是这样，那是违背学术道德和科研伦理的吧？
蒲慕明：鉴于当前疫情的严峻形势，是这样的。
因此我们建议采用“胡萝卜加大棒”的方式促进数据的发表。
所谓“胡萝卜”，就是建议期刊接收发表初步处理的组学数据。即便没有新的数据产出，基于先期数据完善的分析结果也应该继续接收。
所谓“大棒”，就是期刊应当对那些隐瞒公共卫生安全数据的论文严肃对待，拒绝发表这种基于不道德学术行为的研究。
应对数据发布，国内已经建立了一些开放数据库，或开放数据分析平台。
现在不要求你写大文章，也不要求你的写作符合高水平期刊的要求，请大家把数据及时共享到开放的平台上！
作者：李晨阳
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