个人简介

个人职务： 担任生物医学工程系常务副主任，兼管教学、培养。 教育经历： 1992年本科毕业于华中科技大学工程力学专业。1997年硕士毕业于北大流体力学专业。2000年博士毕业于北大流体力学专业。2001－02年北大湍流与复杂系统国家重点实验室博士后，开始转入生物信息学的交叉学科研究。2003年1月留校任教，2006年加入北大工学院生物医学工程系。2007－08年赫尔辛基大学芬兰基因组中心访问学者。目前同时兼任湍流与复杂系统国家重点实验室、北京大学定量生物学中心、北京大学蛋白质科学中心的成员。 主要成就： 先后主持和合作承担国家自然科学基金、国家科技部973计划等国家级项目共计14项。开设研究生专业必修课《生物医学应用数学》、《理论与系统生物学实验》，生物医学工程专业本科生必修课《生物医学工程设计》、专业选修课《计算生物学导论》以及研究生专业选修课《生物医学中的系统生物学》等课程。 所领导的研究小组现指导在读博士生10人、硕士生2人，已指导毕业博士生8人、硕士生6人，并作为博士生导师获得了2010年北京市优秀博士论文、2011年北京大学优秀博士论文二等奖、2011年全国优秀博士论文提名奖。先后获得中国生物医学工程联合学术年会青年优秀论文奖（指导教师、通讯作者），以及北大宝洁奖教金、北大方正优秀奖教金、埃克森-美孚北大奖教金等。 近年来承担的主要课题 1. 主持国家重点研发计划重点专项《重要疫源微生物组学研究》课题“微生物多组学生物信息新算法研究与平台构建（No. 2017YFC1200205）”（2017~2020） 2. 主持国家自然科学基金项目“微生物群落环境适应性的宏基因组学研究（No. 31671366）”（2017~2020） 3. 主持国家自然科学基金重大研究计划培育项目“极端微生物宏基因组微进化的计算生物学研究（No. 91231119）”（2013～2015） 4. 主持北京大学工学院——医学部交叉学科联合研究种子基金项目“ICU医护环境数字化研究”（2012～2013） 5. 参与国家科技部十二五国家科技支撑计划项目“肠道微生物与脑肠轴功能交互作用平台研究”（2012～2016） 6. 主持国家自然科学基金重点项目“神经影像的时间信息提取及其在中枢药物疗效检测中的应用（No. 61131003）”（2012～2016） 7. 参与北京大学临床医院合作专项“肠道微生物与消化代谢相关疾病研究平台”（2012～2015） 8. 主持北京市优秀博士学位论文指导教师科技项目“宏基因组的生物信息学方法和技术（No. YB20101000102）”（2011～2013） 9. 国家自然科学基金创新群体“生物网络研究（No. 11021463）”成员（2011~2013） 10. 负责国家重点基础研究发展计划（973计划）子课题“视觉假体的信息处理及编码理论研究（No. 2011CB707503）”（2011～2016） 11. 主持国家自然科学基金项目“人肠道微生物组的基因预测与序列拼接方法研究（No. 30970667）”（2010~2012） 12. 主持北大医工联合研究种子基金项目“肠易激综合征相关肠道菌群的系统生物学研究”（2010～2011） 13. 参与国家科技部科技重大专项“高成药性先导化合物设计与优化技术研究（2009ZX09501－002）”（2009～2010） 14. 主持国家自然科学基金项目“基于翻译起始机制的原核基因组比较的生物信息学研究（No. 30770499）”（2008~2010） 15. 国家自然科学基金创新群体“生物网络研究（No. 10721403）”成员（2008~2010） 16. 主持GaTech/Emory University --Peking University BME联合种子基金项目“New gene finding methods for shotgun DNA sequences of microbial communities coexisting with a human host” （2008～2009） 17. 主持北京大学工学院青年人才基金“基因预测新方法以及比较基因组学研究”（2006~2009） 18. 主持国家自然科学基金项目“真核基因预测新算法的研究（No. 30300071）”（2004~2006） 19. 负责国家重点基础研究发展计划（973计划）子项目“基于表达调控网络的基因功能预测（No. 2003CB715905）”（2003~2008） 20. 合作承担国家自然科学基金数理学部SARS特别基金项目“SARS及其它冠状病毒演化的数学物理模型分析（No. 10342002）”（2003~2004） 21. 合作承担国家自然科学基金重大研究计划面上项目“真核生物基因转录调控的信息结构及作用原理（No. 90208021）”（2003~2006）