个人简介

个人简介 教育背景： 廖奇，宁波大学医学院副教授，2007年毕业于中山大学医学院，并免试推荐为同校病原生物学专业博士生，师从吴忠道教授。2008年-2011年在中科院计算技术研究所学习和研究生物信息学课题，师从赵屹研究员，2015年8月至2016年8月作为访问学者在哈佛大学丹娜法伯癌症研究中心进修，师从著名的生物信息学家刘小乐教授。 迄今为止以第一作者或通讯作者身份在国际著名SCI期刊NucleicAcidsRes(top期刊，IF=11.561)、Briefingsinbioinformatics(top期刊，IF=6.302)、Bioinformatics(top期刊，IF=5.481)、等发表通讯作者或第一作者论文17篇，合计引用410余次，其中单篇他引最高265次。主持国家自然科学基金、省自然科学基金、市自然科学基金。主讲卫生统计学、SAS、SPSS统计分析等中文课程以及医用统计学留学生全英文课程，参编教材4部，其中《PreventiveMedicine,MedicalStatisticsandEpidemiology》为全英文教材。 工作经历： 1.2018/01-至今，宁波大学医学院，预防医学系，副教授 2.2012/07-2017/12，宁波大学医学院，预防医学系，讲师 3.2015/08-2016/08，美国哈佛大学附属丹娜法伯癌症研究中心，访问学者，合作导师：刘小乐教授 目前从事的主要研究工作： 1.生物公共数据库挖掘及分析，如各类生物数据库如GEO、转录因子、非编码RNA的鉴定及功能注释等； 2.测序数据的处理及分析，如RNA-seq、外显子测序、ChIP-SEQ、CRISPRscreen、基因芯片数据的处理和分析； 3.基因调控网络的构建及分析，构建转录因子-靶基因关系、蛋白蛋白相互作用、lncRNA-靶基因关系等生物调控关系，构建生物调节网络，并对网络进行挖掘及分析； 4.机器学习方法应用，如疾病预测模型或分类器的构建及应用 目前承担的主要科研项目 项目名称 项目来源 项目编号 项目起止时间 基于全基因组CRISPR筛选数据构建泛癌必需lncRNA的预测模型并以大肠癌为例进行预测和调节网络研究 国家自然科学基金/面上项目 31970630 2020-01;2023-12 长非编码RNALINC00473在大肠癌中的功能研究及调控网络分析 宁波市自然科学基金 无 2017-12;2009-12 主持完成的主要科研项目 项目名称 项目来源 项目起止时间 项目编号 结题日期 大肠癌遗传和表观遗传数据库及预测统计模型的构建 浙江省统计局统计研究课题/青年项目 2015-06;2016-06 2016-12 基于表观遗传性质及调节网络对长非编码RNAs的功能注释 国家自然科学基金/青年项目 2014-01;2016-12 31301084 2016-12 大肠癌长非编码RNAs表观遗传调节网络的构建及系统分析 浙江省自然科学基金/青年项目 2013-01;2015-12 LQ13C060002 2015-12 出版著作和教材情况 著作名称 出版社名称 出版时间 本人排名 《HeatlthInformaticsDataAnalysis》 SpringerInternationalPublishing 2017-06 其他 《PreventiveMedicine,MedicalStatisticsandEpidemiology》 浙江大学出版社 2014-07 其他 《预防医学》 东南大学出版社 2014-06 其他 《医学寄生虫学》 中国医药科技出版社 2017-06 其他 《寄生虫学与寄生虫病简史》 国际炎黄文化出版社 2016-11 其他