本科生共同一作！西北大学，发Cell！
2024-11-15
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11月12日，西北大学首届华大创新班毕业生，生命科学学院姚佳俊在本科联合培养期间参与的华大生命科学研究院研究项目成果，以共同第一作者在国际顶级生物学期刊《细胞》（Cell）在线发表，论文题为Spatiotemporal modeling of molecular holograms，西北大学为共同第一作者单位。
图源：Cell 官网
该论文由华大生命科学研究院联合斯坦福大学医学院等机构合作研究，借鉴物理学、地理学、经济学等多个跨学科领域的数学模型，开创性开发了三维时空建模工具包Spateo，使空间转录组学技术能够精细地重构器官三维结构、系统地量化时空动态过程。该工具包的发布标志着时空组学研究迎来革新性突破，可全面支撑胚胎发育、脑科学、疾病等领域研究，为实现高精度时空生命全景观研究迈出了极为关键的一步。
在该成果中，姚佳俊和研究团队开发了Spateo的3D时空建模框架，并将其成功应用于E9.5和E11.5的3D小鼠胚胎发生图谱的绘制，捕获了高达800万个细胞的数据，为胚胎发育研究提供了宝贵的资源。姚佳俊在该研究中主要负责3D模型生成、形态测量与体积分析、形态学骨架构建、形态发生预测以及开发Spateo-viewer可视化工具。
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01159-0
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