分享几个基因组研究相关的sci论文数据库

2022-02-25

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　　1、ICGC (International Cancer Genome Consortium)数据库通过数据库可搜索到自己感兴趣的基因在患者样本中的突变情况，还会提供基因的基本信息和一些注释，包括该基因参与的通路以及相应的GO注释等。最重要的是该数据库可以查看在某种癌症中基因突变的排名情况，从而据此做一些相关研究。网址https://dcc.icgc.org/

　　2、COSMIC(Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer)提供了与癌症相关体细胞突变的信息，记录的体细胞突变比较详细，可以追溯到文献出处，还能将样本信息、涉及的癌症类型等进行统计。COSMIC不仅可以知道一个基因突变的较详细的信息，还可以统计某一肿瘤组织的所有突变信息。网址https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/

　　3、DAVID(The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)主要进行基因功能和通路注释等功能分析，包括功能注释、基因功能分类、基因ID转换等。将感兴趣的基因关联到生物学注释上，利用统计学的方法，在数据库中的关联注释中获取最显著富集的生物学注释，从而筛选该基因的生物学功能。该数据库提供了一种快速的方法，将大量的基因列表缩减为功能相关的基因组信息，以帮助筛选高通量技术获得的生物信息。网址https://david.ncifcrf.gov/

　　4、GeneCards整合了几大类数据库对于基因的分析数据，包括基因组、转录组、蛋白质组、遗传、临床和功能信息，在里面可以找到所感兴趣基因的全面功能信息，包括基因突变信息、表达、功能以及蛋白互作等，还包括各种数据库的相互转换。网址https://www.genecards.org/

　　5、微阵列芯片技术的发展促使了基因芯片的广泛应用，这之中产生了海量的数据资源，为基因的研究提供了有利的条件，为了便于储存及处理这些数据，美国国立卫生研究院旗下的美国国立生物技术信息中心(NCBI)创建了基因表达数据库 (Gene Expression Omnibus, GEO)。 GEO也是当今最大、最全面的公共基因表达数据库之一。网址https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

　　论文是每个作者的心血，花费的时间与精力，都在论文发表的那一刻得到反馈。本期艾思科蓝的学术内容到这里就结束了，如需了解更多相关知识，可以点击进站内搜索关键词。

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